大巴车异地营运由县级以上道路运输管理机构责令改正，没收违法所得，并可处三百元以上三千元以下罚款。
异地营运的处罚具体如下：
1、异地经营未在经营地工商部门注册登记备案或成立分支机构的，属违法经营，由当地工商部门按无照经营进行处罚；
2、责令终止经营活动，没收非法所得，处以非法所得额3倍以下的罚款，但最高不超过3万元，没有非法所得的，处以1万元以下的罚款。
公司异地营运需要办理的手续具体如下：
1、向工商登记机关申请公司名称核准；
2、拟定公司章程；
3、到工商机关办理公司设立登记手续；
4、领取营业执照；
5、到公安机关指定的部门刻制印章；
6、到银行开立基本银行账户及其余账户。
异地经营的情形具体如下：
1、没有经营资格，经营者自行组织客源进行经营，包括包车、自行组客等，这种行为属于违法行为；
2、甲乙双方相互对营，甲方按照合约到乙方，然后从乙方带客返回，这属于合法异地经营。
综上所述，大巴车异地营被发现后，会被处以300到3000元的罚款，因此，一定要在登记地营运。
【法律依据】：
《中华人民共和国道路运输条例》第一条
为了维护道路运输市场秩序，保障道路运输安全，保护道路运输有关各方当事人的合法权益，促进道路运输业的健康发展，制定本条例。
第二条
从事道路运输经营以及道路运输相关业务的，应当遵守本条例。
前款所称道路运输经营包括道路旅客运输经营（以下简称客运经营）和道路货物运输经营（以下简称货运经营）；道路运输相关业务包括站（场）经营、机动车维修经营、机动车驾驶员培训。