法律分析：具体问题具体分析。
1、帮水电站清理清库区淤泥积砂石。这就要看你出于什么目的。如果没有通过河道管理局的批准，你又以卖砂石盈利为目的来清理。这就属于违法采砂。如果是河道管理局批准，水电站雇佣你们清理。这属于正常施工。不违法。
2、征得当地县以上水行政主管部门的同意。
水库清淤是属于社会公益事业，只要不影响水利设施的安全。
法律依据：《排污许可管理条例》 第二条 依照法律规定实行排污许可管理的企业事业单位和其他生产经营者(以下称排污单位)，应当依照本条例规定申请取得排污许可证；未取得排污许可证的，不得排放污染物。根据污染物产生量、排放量、对环境的影响程度等因素，对排污单位实行排污许可分类管理：(一)污染物产生量、排放量或者对环境的影响程度较大的排污单位，实行排污许可重点管理；(二)污染物产生量、排放量和对环境的影响程度都较小的排污单位，实行排污许可简化管理。