1、申请宅基地使用权
首先村民在建筑房屋前应先向村集体组织申请宅基地使用权，取得国土部门颁发的集体土地使用权证书。然后向当地镇规划建设办申请房屋建设的报批手续，进行施工建设。房屋建成后村民应当向规划建设办申请房屋竣工验收，取得规划验收合格证明。
2、向当地房管所提出申请
经过规划建设办批准建设及验收合格的房屋，村民需要办理房屋产权证的，应当向当地房管所提出申请，并提交土地使用证、报建验收证明、房屋面积测绘报告等资料。房管部门在受理农村村民要求办房产证的申请后，经公告无异议或有异议不成立的，将给予登记发证。
在我国当取得房屋的产权后，只有办理了房产证，房屋才真正属于购房者。在农村也一样，有了属于自己的房屋，应该主动积极办理房产证，只有这样才能更有效的保护自己的权益，避免纠纷的发生。农村房产证一定程度上也可以理解为农村房屋宅基地证，在农村建房宅基地是需要审批的，因此，农村房产证办理流程不同于商品房先买房后办证的一般程序,农村房过户流程复杂。农村房产证办理需要村民先提出申请，通过审批后，才能建房并领取房产证。
农村房屋过户需要去乡镇国土所提出申请，提交相关材料后，当地国土所根据申请人提供的权属资料进行审查，实地进行勘丈、调查、公告，报国土局审核，注册登记，发证。
其次，农村房屋过户，房屋所有权依法发生转移，申请房屋所有权转移登记的，应当提交下列材料：
(一)登记申请书;
(二)申请人的身份证明;
(三)房屋所有权证书;
(四)宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明;
(五)证明房屋所有权发生转移的材料;
(六)其他必要材料。